一种肽化月见草籽蛋白生物饲料生产系统，涉及饲料生产领域，包括原料粉碎机；与原料粉碎机一体化加工的混合机；混合物料堆积后形成的发酵堆；与发酵堆相连的上料装置；与上料装置相连的搅拌机；与搅拌机相连的包装机。原料粉碎机专门针对月见草籽这种小颗粒状进行粉碎，两组粉碎辊同时对物料进行粉碎，采用隔板能够完全将物料分开进行粉碎，粉碎效率高、效果好，在下料仓出口处设有筛网，用于筛除未完全粉碎的物料，提高粉碎效果；混合机采用改进后的搅拌组件，搅拌翅采用多个搅拌棒加刀片的形式，提高搅拌效果和效率；发酵堆带有自控温电伴热带和隔氧膜，进一步提高发酵效率和效果；粉碎机和混合机采用一体化设计，提高系统集成化程度。