本实用新型公开了一种基于医药有机中间体杂质的分馏装置，包括蒸汽室、第一电机和第二电机，所述蒸汽室内开设有预热室和加热室，所述预热室与所述加热室通过通道连通，所述通道内部设有单向阀所述预热室底壁通过复位弹簧卡接连接有活塞，所述预热室侧壁开设有进料口。本实用新型的优点在于，通过套管可以用升温的冷凝水预热有机物溶液，使有机物溶液更容易沸腾，预热室可以给加热室提供温度较高的有机物溶液，使加热室内一直保持高温，从而持续提供有机物蒸汽，提高了分馏效率，第二扇叶可以促进第一冷却室和第二冷却室内的水体循环，避免冷却水局部温度过热，从而保证冷却水的冷却效果。