本实用新型公开了干细胞培养基的自动加注系统，涉及干细胞培养领域，针对现有的干细胞培养时的培养基加注操作不便的问题，现提出如下方案，其包括培养瓶、过滤器和氮气罐，所述过滤器与氮气罐之间通过导管连通，且所述过滤器的底端安装有橡胶管，所述过滤器的外壁滑动套设有活动环，且所述过滤器侧壁的下段固定连接有两个呈对称分布的安装板，所述安装板的端部转动安装有导向轮，所述橡胶管的两侧活动安装有夹板，且所述夹板远离橡胶管的一侧与活动环的底端之间连接有牵引绳。本实用新型结构新颖，且该装置在对培养瓶内部加注培养基时不仅能够避免培养基受到污染，同时能够对培养基的加注量进行有效控制，提高了该装置的实用性能。