本实用新型公开了一种燃料电池氢气杂质CO在线监测系统，属于分析仪器技术领域，应用于汽车燃料电池用氢生产装置，包括正压防爆柜，以及柜外的工艺阀门，和柜内依次连接的过滤器、取样泵、减压稳压阀、带针阀的流量计、红外激光式CO分析仪，其中过滤器和红外式CO分析仪另一端分别连接工艺阀门后与进气口和排气口相连接，包括吸附剂罐，与红外式CO分析仪相连接，用于得到零气供分析仪标定。本实用新型可有效保证进入红外式CO分析仪的过程气体压力、流量稳定，无水分，无灰尘。可以保证分析仪的稳定运行，并且大大延长分析仪的使用寿命。本实用新型结构紧凑，可以放置在爆炸危险环境下的工业现场。同时集成了零气发生装置，无需购买昂贵的标准气并省下了气瓶的空间。