本公开提供一种细胞筛选芯片及细胞筛选系统，涉及生物检测技术领域，用于解决目标细胞的捕捉率低的技术问题。该细胞筛选芯片的芯片本体设有进液沟槽和出液沟槽，且沿进液沟槽的导流方向，进液沟槽的末端封闭，进液沟槽和出液沟槽彼此靠近的侧壁之间形成有筛选阵列；筛选阵列的每个筛选单元包括容置腔和与容置腔连通的筛选通道，容置腔与进液沟槽连通，筛选通道与出液沟槽连通；目标细胞的直径大于筛选通道的宽度且小于容置腔的宽度；容置腔的导流方向与进液沟槽的导流方向之间的夹角为锐角，进液沟槽中的样品溶液平稳流入容置腔，减少样品溶液的漩涡与回流，减少目标细胞受到冲击而形变挤出筛选通道的概率，提高目标细胞的捕捉率。