本实用新型公开了高效生物脱氮菌床，包括菌床筒体，所述菌床筒体的内部设置有上层配水区、滤料层、卵石承托层与底部配水区，所述滤料层位于上层配水区的下端，所述卵石承托层位于滤料层的下端，所述底部配水区位于卵石承托层的下端，所述菌床筒体的上端固定连接有封头，所述封头的上端固定连接有一号人孔与吊耳，所述上层配水区的内部设置有反洗挡板与出水挡板。本实用新型所述的高效生物脱氮菌床，适合含氮的被污染水体，特别是低C/N比废水,如污水厂尾水的深度脱氮、地下水修复、工业废水等领域，无需外加碳源、运行成本低，污泥产量少、效率高、工艺简单等，无需停水，不影响目前污水厂的运行，带来更好的使用前景。