本发明公开了一种燃料电池的表面改性蓝钻催化剂及制备方法和燃料电池，该制备方法包括以下步骤S1、采用直径为1‑4000nm的纳米颗粒作为基底材料，对‑基底材料进行预处理；S2、采用化学气相沉积法在‑基底材料上沉积导电金刚石薄膜，即形成蓝钻催化剂；S3、对‑蓝钻催化剂进行使其具有疏水特性或增强其吸氢性能的表面改性处理，得到表面改性蓝钻催化剂。本发明的制备方法制备得到的表面改性蓝钻催化剂的性能优越，将经过表面改性处理后具有疏水特性或吸氢吸能增强的表面改性蓝钻催化剂分别应用于燃料电池的阴极或阳极，都可大大提高其催化效率，因此本发明的表面改性蓝钻催化剂能够很好地取代铂催化剂成为燃料电池的催化剂，有利于燃料电池的大规模应用。