本发明公开了一种富水上软下硬复合地层的盾构掘进施工方法，其特征在于包括如下步骤：1)地质概况探测；2)确定切割区域；3)切割区域成孔：沿切割区域的边缘钻设若干个边缘孔，于切割区域内部钻设与边缘孔的孔深相同的若干个内部孔，并控制边缘孔、内部孔的位置，使边缘孔、内部孔呈网格点状分布；4)钻孔连线切割：采用超高压磨料水射流沿内部孔、边缘孔进行切割，控制切割深度小于等于边缘孔的深度，使切割线与内部孔、边缘孔连接形成网格结构，以将盾构隧道掌子面中的硬质地层区域切割成岩土块体；5)上软下硬复合地层掘进。本发明解决了盾构掘进过程中上下地层物理特性指标差别较大造成的刀盘、刀具磨损等问题，节约了盾构掘进施工成本，使工作环境更绿色环保。