本发明公开了一种透波、高效隔热气凝胶复合材料及其制备方法，具体包括如下步骤：首先配制硅溶胶，将硅溶胶和酸催化剂先以一定比例混合均匀，形成前驱体，再加入碱性催化剂制得硅基溶胶液，通过程序化真空浸渍纤维预制件和溶剂液封，后对其加热老化同时溶剂置换，直至形成初态凝胶，再将其放置于二氧化碳超临界流体干燥釜中进行干燥，待干燥过程完成后，采用高温工艺处理上述复合材料，待烘干处理后再降至室温即得透波、高效隔热气凝胶复合材料。本发明利用超临界干燥以及程序化真空浸渍制备透波、高效隔热气凝胶复合材料的方法，无需引入任何表面活性剂或分散剂，易于操作。