本发明公开了一种用于小麦白粉病鉴定的病菌收集装置，包括工作箱、电机、第一夹紧块、第二夹紧块、驱动组件、气缸和收集组件，第一夹紧块设置在工作箱的内部且其底部设有环形挡板，其侧壁上倾斜设有多个呈条形的第一通口，每个第一通口内均设有第一夹紧组件，第二夹紧块设置在第一夹紧块的正下方且其侧壁上设有多个第二通口，每个第二通口内均设有第二夹紧组件，驱动组件设置在工作箱的内部用于带动第一夹紧块和第二夹紧块同步转动，气缸倾斜固定在工作箱的侧壁上且其活塞杆上垂直固定有平行夹爪，每个夹爪上均设有清扫组件。本发明可以同时将小麦叶片两面的病菌收集进行收集，收集效率高，而且能批量对多个小麦叶片上的病菌进行收集。