本发明公开了一种微波武器在舰艇防空反导体系贡献率评估方法，该方法首先构建反映各方兵力作战能力的指标体系，并赋予指标体系中各指标在作战任务中相应的权重；得到导弹拦截方舰艇编队装备微波武器之前，对导弹发射方舰艇编队发射的反舰导弹进行拦截对抗的体系作战能力；得到导弹拦截方舰艇编队装备了微波武器之后，对导弹发射方舰艇编队发射的反舰导弹进行拦截对抗的体系作战能力，最后得到微波武器在拦截方舰艇编队的舰艇防空反导体系中的贡献率。本发明对双方作战平台携带的武器性能进行定量分析，提出指标体系以评估各方兵力的作战能力，判断微波武器是否能提高己方兵力对抗敌方目标的能力。