本发明公开了一种浮坞泵站托管浮坞水下承载平台结构，包括托管浮坞和水下承载平台，托管浮坞的底面四角处固定嵌设有上安装座，水下承载平台顶面上与各上安装座一一对应嵌设有下安装座，上安装座与托管浮坞的底面相平齐，下安装座与水下承载平台的顶面相平齐；上、下安装座之间连接有液压缸，下承载平台连接有若干钢筒支脚，各钢筒支脚的底端与其正下方的水底基础的距离相同；本发明还公开了相应的施工方法。本发明逆转了先施工好水下承载平台再使摇臂输水管投入使用的顺序，先使摇臂输水管投入使用，再完成水下承载平台的施工，极大提高了浮坞泵站的安装投产效率，并无须承担围堰施工带来的各种问题和成本，具有良好的推广应用价值。