本申请公开了一种脱硫系统和脱硫系统的控制方法，所述脱硫系统包括：氧化风机组，所述氧化风机组包括至少两台功率不同的氧化风机；吸收塔，所述吸收塔包括反应室，所述尾气排放口通过第一管路与所述反应室的内部连通，所述至少两台功率不同的氧化风机中的每台氧化风机的出风口分别通过第二管路与所述反应室的内部连通；控制器，所述燃煤机组和所述氧化风机组分别与所述控制器电连接；其中，所述控制器用于基于所述燃煤机组的实际负荷率，控制所述至少两台功率不同的氧化风机中的至少一台氧化风机启动，以使所述氧化风机组的输出功率与所述燃煤机组的实际负荷率匹配。本申请实施例提供的方案，可以解决现有的脱硫系统存在的功耗浪费的问题。