本发明公开了一种基于卷积神经网络的血脂亚组分含量检测方法，首先制备血清样品，对各血脂亚组分进行分离分析；接着利用基于激光诱导的荧光检测法收集各血脂亚组分对应的荧光蛋白电信号；然后利用经验模式分解对荧光蛋白信号进行去噪处理；再搭建卷积神经网络结构；选择包含荧光蛋白信号及其对应血脂亚组分具体数值的已有数据集；然后基于荧光蛋白信号的特征设计对应神经网络的滤波器，同时将网络结构中最后一层全连接层的输出设置为对于输入荧光蛋白信号对应的血脂亚组分具体数值估计，完成卷积神经网络的结构设计后，利用训练集进行网络训练；最后通过训练好的神经网络模型进行血脂亚组分含量检测，得到检测结果。本发明具有较高的检测精度。