本发明提供一种1,2‑二脂肪酰‑sn‑甘油‑3‑磷脂酰丝氨酸的制备方法，包括如下步骤：使(S)‑甘油缩丙酮、双(二异丙基氨基)(三氯乙氧基)膦、N‑Troc‑丝氨酸苄酯反应并氧化，得到1,2‑O‑异亚丙基‑甘油‑3‑磷酰‑N‑Troc‑丝氨酸苄酯；使所述1,2‑O‑异亚丙基‑甘油‑3‑磷酰‑N‑Troc‑丝氨酸苄酯发生水解反应，得到2,3‑二羟基丙基‑1‑磷酰‑N‑Troc‑丝氨酸苄酯；使所述2,3‑二羟基丙基‑1‑磷酰‑N‑Troc‑丝氨酸苄酯与脂肪酸发生缩合反应，得到1,2‑二脂肪酰‑sn‑甘油‑3‑磷酰‑N‑Troc‑丝氨酸苄酯；使所述1,2‑二脂肪酰‑sn‑甘油‑3‑磷酰‑N‑Troc‑丝氨酸苄酯发生氢化反应，得到1,2‑二脂肪酰‑sn‑甘油‑3‑磷酰‑N‑Troc‑丝氨酸；使所述1,2‑二脂肪酰‑sn‑甘油‑3‑磷酰‑N‑Troc‑丝氨酸发生脱保护反应，得到所述1,2‑二脂肪酰‑sn‑甘油‑3‑磷脂酰丝氨酸。