本发明提供一种木薯整株生物发酵饲料及其制备方法，以木薯、木薯秸秆和/或木豆茎叶作为饲料原料，先膨化后发酵制得木薯生物发酵饲料。本发明提供的技术方案，利用了高淀粉的木薯以及高蛋白的木豆茎叶混合青贮发酵，克服木豆茎叶不是最优饲料原料的技术偏见。本发明通过有益微生物发酵将一些大分子蛋白质及难消化纤维类物质大大减少，降低纤维含量，利于动物消化吸收，提高了饲料的适口性，保留动物所需营养成分，同时还具有饲料成本低、保存周期长、缓解冬季青绿饲草短缺问题，增加木薯、木豆茎叶和木薯秸秆利用率以减少木薯秸秆的丢弃从而减少环境污染的有益技术效果。