本发明公开了一种大通量细胞声分选芯片，包括有压电基片、叉指换能器、分选流道基底和分选流道，其中叉指换能器溅射在压电基片上，分选流道键合在分选流道基底上，从下至上，压电基片、叉指换能器、分选流道基底和分选流道依次进行设置。所述的叉指换能器的形状为弧形或箭头形，弧形的叉指换能器为聚焦型叉指换能器，箭头形的叉指换能器为汇焦型叉指换能器，有益效果：分选流道的特征尺寸能够被增大，有助于提升分选通量与声流作用的效果。分选流道基底为具有凸凹结构的绝缘层基底或浸润性优化基底。规律化的具有凸凹结构的绝缘层基底或浸润性优化基底加大分选流道中的液体中颗粒运动的差异性，提高分选的效率和分选纯度。