本发明公开了一种富营养化水体内藻华的综合治理方法，包括以下步骤：通过拦截网对富营养化水体中藻华进行拦截清理，并定期回收；将回收得到的微藻生物质洗净并于室温晾干后，制备成微藻基多孔碳材料；将所得微藻基多孔碳材料填充至所述拦截网中。微藻基多孔碳材料制备方法包括如下步骤：将回收得到的微藻生物质用蒸馏水清洗1～3次，在通风环境中放置整夜，再置于烘箱中进一步干燥24～48h，研磨粉碎，得到干燥的微藻生物质；将干燥的微藻生物质置于气氛炉中，在氮气或氩气等保护气体的氛围下，以5～10℃/min的升温速率升至150～800℃并保温2～4h。本发明提供的一种富营养化水体内藻华的综合治理方法，将富营养化水体内有害藻华的回收、利用与治理有机结合，具备使用简便、经济高效、生态友好优点。