本发明公开了一种以酒糟为原料提取复合氨基酸的工艺方法和应用，所述方法包括以下步骤：将酒糟用酒精泡发；将泡发好的酒糟浸泡在水中，55‑95℃搅拌1‑5h，固液分离得酒糟浸提液和酒糟残渣；所得酒糟浸提液经过超滤膜组过滤去除微小固体杂质，然后经过葡聚糖凝胶分子筛水洗去杂、洗脱、浓缩得A组分氨基酸；所得酒糟残渣在80‑100℃加热醇提2‑4h，醇提液经过超滤膜组过滤去除固体杂质，然后经过葡聚糖凝胶分子筛水洗去杂、洗脱、浓缩得B组分氨基酸；将步骤3所得A组分氨基酸和步骤4所得B组分氨基酸合并后脱水干燥得复合氨基酸。该工艺方法通过水提和醇提相结合，大大提高了酒糟中提取氨基酸的提取效率，获得了含量更加丰富且种类更加齐全的复合氨基酸。