本发明涉及一种基于无人机的江河鱼类资源量统计方法及系统，包括：利用无人机和无人船获得待统计河流的水深数据；根据待统计河流的宽度数据、长度数据和水深数据获得待统计河流上游断面和下游断面之间的水体体量；从待统计河流的上游断面和下游断面之间选择N个断面；获得各断面两侧设定范围内水下图像数据；根据各断面两侧设定范围内水下图像数据，采用图像识别算法统计各断面两侧设定范围的鱼的种类和数量；根据各断面两侧设定范围的鱼的种类和数量，获得设定范围内鱼的种类的平均值和数量的平均值；根据水体体量与设定范围内鱼的种类的平均值和数量的平均值，获得待统计河流中鱼的种类和数量。本发明提高了统计效率和精度。