本发明公开了一种林木种子催芽装置及其方法，包括催芽箱体，催芽箱体的外型为从下至上半径增大的锥柱型，催芽箱体的上端可拆卸安装有催芽箱盖，催芽箱盖的上端穿插有若干个喷头，催芽箱体内底部均匀垂直安装有若干个搅拌棒，搅拌棒内设置有加热丝，催芽箱盖内设置有保温罩框，保温罩框内上端设置有凸起的保温罩体，保温罩框的下端可拆卸设置有网盖；与现有技术相比，本发明的有益效果是：在对林木种子消毒时通过喷头来喷洒消毒液进行消毒，方便快速；在拌种时可以将沙子和种子一同装入催芽箱体，并且通过将催芽箱体立起滚动的方式，实现将搅拌棒对种子与细棉沙搅拌，整个拌种的过程方便快速，拌种效果较好，相比于手动搅拌省时省力。