本发明公开了一种高频噪声幅值增益的自动跟踪系统及方法，涉及火电机组过程控制技术领域。所述系统包括改进新型基础控制器、一阶惯性滤波器、超前滞后观测器、高频噪声幅值增益计算模块、比较器、积分控制模块和乘法器，获取所述改进新型基础控制器的噪声滤波参数原始值，并构造反馈过程控制过程、自动跟踪/停止过程以及反馈过程控制过程。本发明利用信号中含有的噪声干扰信号完成高频噪声幅值增益的在线计算，能够使得改进新型基础控制器的性能控制在最佳的状态下。