本申请属于飞机热效应模拟设计技术领域，涉及一种机载系统实时热等效模拟方法及系统。热等效模拟方法包括：步骤S1、确定机载设备在实际工况下的实际热效应；步骤S2、对所述热效应进行缩比，获得缩比后的模拟热效应，所述模拟热效应至少包括热量数据及用于进行机载设备热交互的流体的流量数据；步骤S3、根据所述模拟热效应的热量数据，控制电加热装置对流体进行加热，所述流体被配置称与机载其他设备的热等效接口进行热交互，同时根据所述模拟热效应的流量数据控制流体驱动装置运转，所述流体驱动装置被配置成驱动流体按设定流量流动。本申请降低了成本和实验难度，实现了机载系统热管理方案快速验证迭代。