本发明公开了一种管端自动冲切贴膜机构，涉及水芯材料制造设备技术领域。包括冲切模组，设置在冲切模组下方的硅胶管载物盘，输送防水透气膜到冲切模组与硅胶管载物盘之间的输送模组；冲切模组包括冲切气缸、设置于冲切气缸的输出轴端处的冲切刀组；输送模组包括分别设置于冲切模组两侧并套设防水透气膜卷的传送卷辊以及用以带动传送卷辊转动的传送电机；防水透气膜在冲切模组下方移动，冲切气缸工作使冲切刀组向下运动，切割防水透气膜并将切好的防水透气膜贴合到硅胶管载物盘上的硅胶管的端面上。本发明可重复在硅胶管端面处贴膜，提高了试验用水芯材料的制造效率，整体装置自动化程度高，使实验用水芯材料的工业化制造技术得到极大进步。