本发明公开了一种实时原位检测有机废水中BOD的生物电化学方法，包括1)：通过MFC模式闭路运行生物电化学反应器，在阳极室加接种溶液；2)：在基质溶液中培养生物电极，至电极生物膜成熟；3)：将生物电化学反应器连接恒电位仪构建生物电化学传感器、并进行线性伏安扫描，其中生物电极置于含有不同BOD浓度的单一有机物溶液中，选取不同电位下电流进行拟合，确定最优信号输出电位、获得输出电流信号与单一有机物浓度之间的线性方程；4)：获得输出电流信号与各有机物浓度的线性方程，计算各有机物相对单一有机物的相对产电率；5)：计算有机废水的相对产电率，及传感器在有机废水中输出电信号，获得有机废水BOD浓度。