本发明涉及一种高压泵泵轴加工方法，由加工装置进行加工，包括：机座、旋转机构、卡爪、顶尖、控制装置；加工装置，还包括：用以对泵轴损伤处进行去除的磨削装置；用以对磨削后的泵轴外圆进行加工补焊装置；泵轴补焊后，再通过磨削装置对泵轴外圆进行处理，以此达到要求尺寸；磨削装置，包括：横移基座、前/后滑座、前/后驱动电机、前/后齿轮箱、前/后护罩、前/后砂轮、补焊装置，包括：支撑座、主动机构、从动机构、补焊机构、丝杠、连杆、定位杆、上驱动电机、下驱动电机。本发明的一种高压泵泵轴加工方法，对主轴深损伤进行处理，处理的过程简便、价格低、工期短。