本发明公开了一种基于物理与数据驱动的集群系统可靠性数字孪生建模方法，能够有效描述集群系统的物理结构，体现空间环境特征对集群系统的影响，反应相关人员的工作状态，实现集群系统可靠性的快速高效评价。步骤如下：构建系统类智能体用于模拟系统与保障资源的物理组成以及集群的拓扑结构；构建环境类智能体用于模拟集群系统执行任务过程中的场景区域，环境条件及其扰动；构建人员类智能体用于模拟集群系统维护和操作人员的工作状态；构建管理类智能体用于模拟集群系统的预定任务与动态生成任务；定义两类数据驱动机制用于实现智能体间的信息交互以及物理实体与智能体间的数据传输；动态采集相关数据，生成集群系统可靠性数字孪生模型。