本发明公开了一种低扰动深海多金属结核采集传动机构，包括具有封闭式壳体的采矿车体，壳体前端分别安装有液压传动臂和伸缩式传输管，传输管的前端固定连接结核抽铲口，结核抽铲口分别与液压传动臂的两个支臂连接；壳体内设置有多节相匹配的传送段，部分传送段的相对两侧面和顶部设置有喷头，多节传送段的末段的后端斜下方对应设置有料仓，料仓与壳体外部的输料管道连通；多节传送带的下端有污泥收集排离传送段，污泥收集排离传送段末端有清扫及储泥装置，清扫及储泥装置的下方有排泥口；壳体外部有过滤排水泵。本发明还公开了利用该机构的采集方法。本发明能够实现深海多金属结核的低扰动、绿色、高效采集。