本发明公开了一种基于深度神经网络的MRI良性前列腺增生目标区域自动生成方法，包括如下步骤：1)在术前获取良性前列腺增生病人的核磁共振图像，并进行切片和数据预处理；2)获得切片在水平面的中间带和周边带的生理轮廓分图像；3)完成前列腺生理轮廓的三维分割，同时生成前列腺生理结构的三维点云模型；4)基于前列腺中央带切片建立虚拟人工势场，并对关键方向进行加强保护，得到安全系数在切片上的分布，进而得到合理的目标区域；5)对包含目标区域轮廓的前列腺切片进行三维重建，最终得到三维的良性前列腺增生手术目标模型。本发明方法可以实现对前列腺和BPH目标区域的三维重建，提高BPH手术的安全性和效率具有推动作用。