本发明涉及一种政务信息资源普查方法、系统以及存储介质，普查员利用智能移动终端外出进行数据采集，将采集到的被普查单元输入智能移动终端生成第一普查地图，无人航拍模块根据第一普查地图依次飞行至普查员该次外出普查的各个普查单元，服务器接收普查员录入的第一普查地图，和无人航拍影像输入的第二普查地图；清单生成模块对第一普查地图和第二普查地图进行标记，分析模块将第一普查清单和第二普查清单进行匹配，若发现第一普查清单和第二普查清单存在不匹配的地方，进行报警提醒。本发明可靠性好，通过人普查员和无人航拍模块双保险操作，再将两者进行对比，确保了数据的可靠正确性。并且能够及时修正和更新，大大提高了普查的可靠性。