本发明公开了一种多端口中低压交直流混合微电网的能量分层控制方法，包括；提出基于模块化多电平变换器的新型五端口中低压交直流混合微电网互联方案，以此构建交直流混合微电网系统；根据所建系统，制定能量管理层控制方法，接收来自负荷调度中心的信息，选择各微电网运行模式(并网运行和电压源运行模式)，确定中压直流微电网、2个低压直流微电网及低压交流微电网的运行模式及功率参考值，从而使系统获得更快的动态响应，避免电压及电流过冲；根据所建系统，制定模块化多电平变换器控制方法，跟踪能量管理层传递的交流输出电流参考值和环流参考值的直流分量，通过载波移相脉宽调制，生成桥臂电压输出信号，均衡桥臂内各子模块电容电压；制定中压直流微电网接口变换器控制方法，当中压直流微电网在并网和电压源两种模式下运行时，双主动全桥变换器作为中压直流微电网的直流/直流变换器，采用单移相控制方法来控制双主动全桥变换器；制定全桥变换器—高频变压器控制方法、全桥变换器等的功率控制方法。