本发明公开了一种多核系统及系统间的隔离逻辑装置和隔离逻辑配置方法，多核系统包括第一子系统和第二子系统，隔离逻辑装置包括：对应第一子系统设置的第一CPU；对应第二子系统设置的第二CPU；对称分布在第一子系统和第二子系统中的第一隔离逻辑单元和第二隔离逻辑单元，第一隔离逻辑单元与第一CPU相连，且根据第一CPU的配置对第一子系统和第二子系统之间的传输进行隔离，第二隔离逻辑单元与第二CPU相连，且根据第二CPU的配置对第二子系统和第一子系统之间的传输进行隔离，从而通过对称隔离逻辑，避免单个子系统复位对其他子系统复位的影响，减少子系统之间的逻辑干扰，确保多核系统之间的隔离操作可以独立完成。