本发明公开了一种砗磲亲本原位催产方法。它包括亲本选择、原位催产、幼虫检查、催产效应评估等技术环节。本发明不同于砗磲全人工繁育方法，筛选野外半封闭潟湖等环境作为催产场，夜间进行原位催产，尽最大努力模拟人工苗种生产过程，规避风险和敌害，批量化获得与野生苗种一致的人工催产型苗种；结合现代分子标记技术进行亲子识别，评估其原位催产效应。本发明充分利用了砗磲幼虫期浮游特性，借助于海浪、洋流等实现大面积扩散，形成部分砗磲苗种聚集区，为今后砗磲繁育提供充足的亲本，为我国南海砗磲资源快速修复提供技术保障。本发明具有简便易行、效果显著等优点。