本发明公开了一种河道底泥原址土壤化生态修复方法，包括在待处理河道两侧挖至少一氧化沟，将达到发酵条件的底泥铺设在氧化沟里，发酵前加入有机调理剂、微生物、钝化剂及土壤改善底泥性质，促进堆体好氧发酵，除去底泥中臭味、异味，并且降低了底泥中重金属毒性，经过好氧发酵，底泥可以转变成具有丰富腐殖质的土壤，既解决了河道内源污染问题，又可以用来种植绿植，固土护堤，同时提供丰富的肥力，具有良好的生态效益。