本发明公开了一种基于MOF模型的全民健康信息数据湖构建方法，首先提炼运行时模型，定义元元模型，使用元元模型构建元模型，使用元模型构建M1模型，将模型中的服务模型关联上要调用的数据模型，将模型中的业务模型关联上要调用的服务模型；最后调用模型中的业务模型完成数据入湖及数据出湖；本发明通过上述MOF中四层模型与医疗卫生信息领域进行对照构建出相应的以个人健康信息为中心的应用模型，解决了高效兼顾灵活地存储不同粒度全民健康信息数据问题。按照该应用模型构建出来的全民健康信息数据湖也大大地降低了成为数据“沼泽”的风险，同时也能够促进和加速医疗卫生信息的互联与共享。