本申请提供一种航天器指令发送状态的确定方法及系统，方法包括：接收比判申请信息以及对应的小环比对信息队列，比判申请信息在指令发送控制系统发送控制指令之后生成；地面站响应于控制指令向航天器发送至少一个指令码；根据比判申请信息和小环比信息队列确定每个控制指令对应的航天器指令发送状态，进而可监控航天器；该方法设计了基于小环比对信息的比判架构和发送状态比判流程。通过引入地面站反馈的小环比对信息，自动化完成地面站发送状态的判断，输出比判结果，实现了对指令发送执行的中间节点监视判断，使地面控制中心能够快速定位指令发送过程中出现故障的环节，同时能够进一步监控航天器状态。