本发明公开了一种基于离子交换膜的中性等离子体活化水制备装置及方法，反应腔室经由用于水溶液中离子交换的离子交换膜分隔为阳极腔室和阴极腔室；混合腔室经由第三蠕动泵连接阴极腔室以泵入碱性溶液以及经由第二蠕动泵连接酸性电位水出口以泵入酸性溶液，且按比例混合，等离子体发生器在高压下生成冷等离子体且连通混合腔室，监测与控制电路连接功率控制器、pH监测器、单向阀和第一至第四蠕动泵，监测与控制电路发送功率信号到功率控制器以控制电解电极和/或等离子体发生器，基于pH值，发送水量信号到第二蠕动泵、第三蠕动泵和第四蠕动泵，基于第一蠕动泵和第三蠕动泵的排水量，监测与控制电路发送水量信号到单向阀。