本申请实施例属于生物医学信号处理领域，涉及一种基于频域信号与时域信号的模态融合胎心率分类方法，包括获取胎心率信号，提取胎心率信号在时域模态的时域特征；将胎心率信号从时域模态转换到频域模态，提取胎心率信号在频域模态的频域特征；计算时域特征在时域向量表征对应位置点的注意力值以及频域特征在频域向量表征对应位置点的注意力值；将时域特征在时域向量表征以及频域特征在频域向量表征同一顺序的位置点的注意力值进行融合，并获得融合后的胎心率融合表征结果；获得胎心率融合表征结果的预测分类标签，完成胎心率的诊疗结果。本申请还提供一种基于频域信号与时域信号的模态融合胎心率分类系统。本申请完成对胎心率信号的提纯。