本发明公开了一种用于消息存储处理和安全认证的控制方法、系统和介质，可应用于通信安全技术领域。本发明在发布者客户端采用消息密钥对原始消息进行加密，在订阅者客户端采用消息密钥进行解密，使得原始消息在传输过程中处于加密状态，从而提高原始消息的安全性，并且，在安全认证中心根据消息密钥生成过程密钥，使分布代理从安全认证中心获取过程密钥后，采用过程密钥对第一加密消息进行二次加密，使得分布代理在仅仅知道过程密钥时，无法推出消息密钥，从而解决消息在代理端以明文形式进行处理时的安全问题，提高密钥安全性。