本发明提供一种用于农业面源污染治理的氮磷治理的排水渠结构，涉及排水渠领域。该用于农业面源污染治理的氮磷治理的排水渠结构，所述氮磷治理的排水渠结构包括第一段和第二段，所述第一段和第二段之间设置有过滤箱，所述氮磷治理的排水渠结构的底部铺设有预制底板，所述预制底板的两侧均设置有水泥挡板，所述氮磷治理的排水渠结构的两侧边坡铺设有植草砖，所述第一段中，两水泥挡板之间铺设有第一多孔介质，所述第一多孔介质的上方铺设有鹅卵石，所述第二段在第一段的基础上还铺设有陶粒，所述氮磷治理的排水渠结构的边坡下部以及鹅卵石的两侧均铺设有第二多孔介质。采用植物种植和微生物处理的方式，使得水渠具有净化能力。