本发明公开了一种光传输网络资源优化配置方法、系统及其存储介质，光传输网络资源优化配置方法包括以下步骤：步骤1，对光传输网络进行系统模型的构建；步骤2，基于业务均衡原则选取预设的链路作为资源的备选链路集L；步骤3，对所述备选链路集L附加业务均衡系数；步骤4，基于链路成本对备选链路集L附加链路成本系数；步骤5，基于所述业务均衡系数与链路成本系数对负载路径进行动态配置，实现光传输网络资源的优化配置。本发明在链路资源分配不均造成链路通信质量下降或链路故障的场景下，充分利用业务均衡的思想，并综合考虑链路的路径成本进行负载路径的动态配置，从而提高光传输网络的通信服务质量与业务可靠性，降低网络综合承载成本。