本发明提供的一种智慧交通数据加密方法及系统，涉及智慧交通技术领域。在本发明中，获取每一个交通监控设备采集的交通监控视频，得到多个交通监控设备对应的多个交通监控视频，其中，每一个交通监控视频基于对应的交通监控设备对对应的交通监控区域进行监控得到，且每一个交通监控视频包括多帧交通监控视频帧；确定多个交通监控视频之间的视频相关关系信息；基于多个交通监控视频之间的视频相关关系信息，确定出对应的视频加密方式信息，并基于视频加密方式信息对多个交通监控视频进行加密处理，得到对应的目标加密视频。基于上述方法，可以改善现有技术中数据加密效果不佳的问题。