本发明提供的一种智慧交通数据保护方法及系统，涉及智慧交通技术领域。在本发明中，基于确定的视频加密方式信息对获取到的多个交通监控视频进行加密处理，得到对应的目标加密视频；在获取到针对目标加密视频发送的数据查询请求信息之后，对数据查询请求信息进行验证处理，得到对应的数据查询验证结果；若数据查询验证结果属于第一数据查询验证结果，则在基于目标数据查询终端设备的历史数据查询记录信息确定目标数据查询终端设备基于数据查询请求信息进行的数据查询属于非法查询时，对对应的目标加密视频进行数据查询保护处理。基于上述方法，可以改善现有技术中对数据保护的可靠度不佳的问题。