本申请涉及一种影像数据处理方法、计算机设备和存储介质。所述方法包括：计算机设备将包括器官、血管和病灶的医学影像数据分别输入至不同的分割模型中，得到各分割模型对应的分割结果，根据各分割结果进行三维重建，得到包括器官、血管和病灶重建图像，基于重建图像构建病灶的曲面模型，并基于曲面模型对病灶进行模拟切除。在本方案中，基于器官、血管和病灶分别对应的分割模型得到各个分割模型对应的分割结果，该分割结果比较准确，基于各个分割结果得到的重建图像也比较精确；基于重建图像构建病灶区域的曲面模型，可以基于曲面模型直观地观察病灶，并基于曲面模型进行病灶的模拟切除，为用户的病灶切除操作提供有效的数据支撑。