本发明公开了一种微电网系统电池充电控制方法。步骤如下：A、在给负载供电时，将储能变流器设置为发电机组以恒压/恒频模式的运行方式并且要满足设定条件；B、当采用发电机组给储能电池充电时，先启动发电机组，将储能变流器设置为发电机组模式以恒功率模式与发电机组并网运行并满足以下条件：通过储能变流器设置电池的充电功率值，同时给负载供电，但负载功率与储能电池的充电功率之和小于发电机组的额定功率。采用上述的方法后，通过将储能变流器设置为发电机模式以恒功率模式与发电机组并网运行，从而可以实现对储能电池的可靠充电并且保证充电安全可靠性以及节省能耗，解决了小型发电机组与储能变流器并网运行给电池充电难度的难题。