本发明公开了一种多通道采样方法、系统、存储介质以及电子设备。多通道采样方法包括：接收事件采集指令，根据预先配置的连接配置数据中的第一组配置数据配置多路PWM和ADC的对应关系，开启事件采集；当采集到PWM事件信号时，向PWM对应的ADC连续发出预设采样通道数的采样触发信号，触发PWM对应的ADC通道进行采样；若已完成对PWM对应的ADC的所有通道的采样，则向PWM对应的ADC发送同步信号，使PWM对应的ADC从起始采样通道开始采样。由于能够自动切换多路PWM模块与SAR ADC的事件信号连接，还支持多路PWM模块事件信号异步触发ADC多组通道，使用方便；避免了因为一次误触发而使采样通道持续错乱，提高了可靠性；可以共享一路高速SAR ADC模块，大大节约了微控制器面积。