本发明涉及一种有限元建模方法及计算机存储介质，属于计算机辅助工程领域。该方法包括：对输入的多个几何对象分组并分别进行网格生成处理，得到每组几何对象所对应的表面网格，并对每组几何对象所对应的表面网格分别进行错误修复处理，得到每组几何对象所对应的独立表面网格；对所有独立表面网格进行兼容化处理，得到初步表面网格系统，对初步表面网格系统进行网格重划分处理得到表面网格系统，并对表面网格系统进行特征提取，得到特征信息；根据表面网格系统和特征信息建立三维有限元模型。借助于上述方法，能实现对多工程对象耦合体系的快速有限元建模，其有效提高了有限元建模整体流程的效率与功能集成度。