一种CNG压缩机主电机使用效率的自动控制方法，包括以下步骤：1)在控制器中预设主电机的效率下限η_min、效率上限η_max、主电机的额定功率P_N、油泵排量V、油泵容积效率η₀；2)主电机启动，计算油泵吸油口和排油口的实时油压差Δp；3)根据预设的主电机参数和油压差Δp计算给定主电机的初始转速n；4)设定采样周期，计算主电机的效率修正值，并计算功率控制偏差率；5)根据主电机的效率修正值和功率控制偏差率，计算本次采样周期的主电机效率η₂；6)根据主电机效率η₂，计算实时修正的主电机转速，使主电机按修正后的转速运行；7)根据设定的采样周期，按步骤4)至6)进行新的采样周期，如此往复不断修正主电机转速，由此控制主电机使用效率。