本发明涉及药物中间体合成技术领域，尤其是一种利用连续流微通道反应器合成瑞舒伐他汀钙中间体的方法，包括以下步骤：1)将化合物II与溶剂混合，搅拌溶解，得物料A；2)将二异丙基氨基锂与溶剂混合，搅拌溶解，得物料B；3)将乙酸叔丁酯与溶剂混合，搅拌溶解，得物料C；4)将所述物料B和所述物料C分别泵入至微通道反应器中混合均匀，再泵入所述物料A进行化学反应；待反应结束后，用盐酸淬灭，调节pH至3～4，分液、萃取、洗涤、干燥后，得到目标产物。采用本发明的方法，反应时间极短，反应条件温和，目标产物收率高，收率达到90％以上，纯度达到99％以上，成本低，节约资源，产物后处理简单，对环境友好。