本发明公开了一种船舶运动模型的处理方法、装置及存储介质，能够结合环境因素，构建船舶运动响应数字孪生模型，结合运动参数辨识模型实时优化船舶运动响应模型，实现对船舶运动实时的较精确的预报。该方法包括：实时获取真实环境的风浪流状态，根据风浪流状态结合风浪流数学模型构建环境数字孪生体；根据环境数字孪生体，对环境干扰力分析得到分析结果；获取实船的传感器数据，结合运动参数辨识模型构建船舶运动模型；根据分析结果，对船舶运动模型在实时环境干扰下进行仿真，得到船舶运动状态仿真结果；根据船舶运动状态仿真结果，计算得到船舶运动状态仿真结果与实船运动响应的误差小于阈值，得到反映实时风浪流干扰的船舶运动响应模型。